根据近年来的研究，发现参与哺乳动物基因活动的lncRNA已经有上千个，研究者已发现lncRNA能够在多种层面调控基因表达，其通常在表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等层面上参与基因表达调控。这里，我们以一lncRNA为例，研究其在疾病中的转录调控机制和功能研究。
研究思路：
首先，需要确定目的基因lncRNA在疾病种存在表达异常；
其次，研究目的基因lncRNA在疾病中的作用；
第三，通过组学实验，找出其下游的作用分子B，并进行验证；
第四，证明B分子与疾病的发展有关，寻找作用机制；
最后，进一步确定lncRNA的功能，通过敲除或过表达实验，进一步验证其在该疾病中的功能，随后得出结论。
研究路线：
1. 通过qpcr实验，验证lncRNA在正常组织和疾病组织中的表达异常，于此同时，由于后续有相关的细胞实验，故也选择3-5种疾病相关细胞和正常细胞进行验证，根据表达量高低来分析临床意义。
2. 通过体外实验，检测lncRNA在疾病中的作用。如敲低或过表达后，通过组学实验如蛋白组学、转录组学等，富集分析其与什么功能相关；再次，通过细胞实验，检测其相关功能，进一步验证目的基因在疾病中的作用。
3. 可通过RNA Pull down-MS实验，筛选与转录相关的转录因子和转录因子作用的蛋白；
4. 敲除lncRNA，检测下游作用蛋白表达是否发生变化，并进行相关功能研究；
