RIP(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA结合蛋白免疫沉淀)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络过程中的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的抗原蛋白-RNA复合物沉淀下来,经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行qPCR或者RIP-Seq分析。RIP-Seq将RIP技术与高通量测序相结合,能够高通量地检测与特定蛋白结合的RNA。
目的蛋白的抗体结合于磁珠上,与细胞内的抗原蛋白-RNA复合物孵育,由于抗原抗体的作用,会形成磁珠-抗体-抗原蛋白-RNA的复合体,通过磁珠讲该复合体拉下来后,经过洗脱获取抗原蛋白-RNA产物,该产物经过RNA纯化后即可获取到诱饵蛋白结合的RNA。
● 实验方法
① 收集足够量的细胞/组织; ② 裂解细胞,提取蛋白-RNA复合物; ③ IP抗体与protein A/G磁珠结合,免疫共沉淀抗原蛋白; ④ 洗涤结合的杂质; ⑤ 蛋白酶K消化蛋白,提取RNA并进行RNA 逆转录; ⑥ 结合的RNA序列通过定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)方法来鉴定。 |
● 服务内容
服务类型 | 客户提供 | 服务内容 | 周期 | 价格 |
标签抗体 RIP-qPCR |
ü 实验样本 ü 待验证目的蛋白WB抗体 ü 实验信息表
| ² 样本裂解 ² Input样本Western blot检测 ² RNA结合蛋白免疫共沉淀RIP实验 ² IP蛋白产物qPCR检测 ² 出具实验报告 | 3周 | |
内源抗体 RIP-qPCR |
ü 实验样本 ü 诱饵蛋白IP用抗体 ü 待验证目的蛋白WB抗体 ü 实验信息表
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标签抗体 RIP-Seq |
ü 实验样本 ü 实验信息表
| ² 样本裂解 ² Input样本Western blot检测 ² RNA结合蛋白免疫共沉淀RIP实验 ² IP产物Seq测序和分析 ² 出具实验报告 | 7周 | |
内源抗体 RIP- Seq |
ü 实验样本 ü 诱饵蛋白IP用抗体 ü 实验信息表
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● 案例展示
● 应用领域
01 | 02 | 03 |
研究细胞内RNA与蛋白结合情况 | 发现RNA结合蛋白(RBP)与非编码RNA(LncRNA、 miRNA、circRNA等)的相互作用 | 研究RNA结合蛋白(RBP)参与mRNA的转录和成熟包括 加工、转运、稳定、降解和翻译等生物过程 |
04 | 05 | |
研究转录后调控研究、表观遗传调控 | 研究mRNA分子在转录后水平受到核糖核蛋白 复合体(RNP)的调节 |