软件：Graphpad prism 9
数据：以qpcr的R2-△△Ct值为例（3组，每组10个生物学重复样本）
C | T | M |
1.00 | 0.45 | 0.89 |
0.80 | 0.56 | 0.83 |
0.87 | 0.49 | 0.66 |
1.01 | 0.64 | 0.80 |
0.71 | 0.51 | 0.87 |
0.92 | 0.42 | 0.78 |
0.78 | 0.30 | 0.67 |
1.13 | 0.54 | 0.71 |
1.07 | 0.62 | 0.78 |
1.10 | 0.65 | 0.66 |
方法：
打开Graphpad prism 9选择Column
2. 复制qpcr的R2-△△Ct数据，粘贴到Data Tables中
3. 找到Graphs（图），点击以上数据对应的名称,就会出现图形了
4. 选择图形，图形有Individual values，Box and violin，Mean/median & error，可以选择自己喜欢的图形，这里选择Individual values中的第二个，如下图；plot选择“mean with SEM”（均数加减标准误），SEM为标准误，与SD关系为SEM=SD/Sqrt(n)，因此SEM会远小于SD，作图会更好看些
5. 接下来是调整图形的颜值：
（1）调整命名，可选择删除Data1和Xtitle标题，点击Y轴重新命名
（2）通过change版块调整
：更换图表类型；
：选择colors，默认选择蓝色和、红色和绿色
：调整图形的大小
：改变X轴和Y轴的信息
：改变柱子的外观
根据以上方法，按照自己喜欢的风格，自己多摸索，就可以得到做出自己喜欢的图形，我们得到的图形如下：
6. 接下来就是进行统计学分析了，首先我们先看一下统计学分析思路：
备注：Kraskal wall’s检验为非参数检验。
7. 需要确定是否符合正态分布：点击Analysis，选择Column analyses——选择Normality and Lognormality Tests，即正态性检验
8. 看正态分布检测结果，一般认为，P>0.05时，数据符合正态分布。这里有几个检测，都满足了正态分布，可以考虑用参数检验中的One-way ANOVA检验（如果不满足，则选择非参数检验）
备注：结果列表中，当几种检验不一致时，小样本以shaprio-wilk test为准，大样本以kolmogorov-smimov test为准。
9. 点击对应的Data，点击Analysis，选择Column analyses——选择One-way ANOVA(and nonparametric or mixed) 即单因素方差分析或非参数检验
10. 查看结果，P值>0.05,故满足方差齐性。(注意，如果不符合方差齐性，需要重新进行One-way ANOVA(and nonparametric or mixed即非参数检验)，equal SDs选择Brown Forsythe and welch ANOVA test矫正，再重复一次分析)
11. 显著性分析结果
12. 显著性分析结果作图，prism 9以上的版本，可选择自动增加显著性分析作图Draw-Automatically add painwise comparisons。
13. 保存。建议保存矢量图格式，如PDF，也方便后续在AI上编辑。
