互作实验送样说明
样本制备和送样说明
2023-05-06
浏览量:1549

 


一、样本准备量

实验类型

样本类型

样本要求

收集方法

运输条件

实验通用

质粒

2ug

见下文

干冰/冰袋运输

甘油菌

1ml

见下文

干冰/冰袋运输

CoIP-WB   /

Pull down-WB   /

RNA   Pull down-WB /

DNA Pull   down-WB /

RIP-qPCR   /

Chip-qPCR

蛋白

6-10mg/

见下文

干冰运输

组织

1g/

见下文

干冰运输

细胞

3*10e7/

见下文

干冰运输

菌体

50ul/

见下文

干冰运输

IP抗体

10ug

见下文

根据抗体保存条件定

WB抗体

可稀释体积为20ml的抗体量

见下文

根据抗体保存条件定

血液

全血

3ml

见下文

4℃运输

血清

300ul

见下文

干冰运输

血浆

300ul

见下文

干冰运输

CoIP-MS   /

Pull down-MS   /

RNA   Pull down-MS /

DNA Pull   down-MS /

RIP-   Seq /

Chip-Seq

蛋白

10-15mg/

见下文

干冰运输

组织

2g/

见下文

干冰运输

细胞

5*107/组(约5个10cm皿)

见下文

干冰运输

菌体

100ul/

见下文

干冰运输

IP抗体

15ug

见下文

根据抗体保存条件定

血液

全血

5ml

见下文

4℃运输

血清

500ul

见下文

干冰运输

血浆

500ul

见下文

干冰运输

WB检测

蛋白

100mg/

见下文

干冰运输

组织

1g/

见下文

干冰运输

细胞

3*10e7/

见下文

干冰运输

血液

全血

2ml

见下文

4℃运输

血清

200ul

见下文

干冰运输

血浆

200ul

见下文

干冰运输

其他样本

请咨询



二、样本收集

1. 基因模板样品

1.1 质粒载体

若提供质粒总量不低于2ug,浓度不低于50ng/ul,也可提供甘油菌1ml即可。需提供质粒测序结果,和载体图谱。可以-20℃/-80冰箱中贮存,冰袋或者干冰运输。


1.2 PCR产物

若提供PCR产物,请提供大于20ul的量,同时需要提供凝胶电泳图和PCR产物测序结果,可以-20℃/-80冰箱中贮存,冰袋或者干冰运输。

 

2. 组织样品

组织离体15分钟内,立即将其用消毒过的刀具切成黄豆大小(直径约0.5cm)的小块,PBS或生理盐水洗净血液、体液等影响实验结果的残留成分。随后将样本小块置于液氮中速冻,放入EP管中保存,再放入-80℃冰箱中或者液氮罐中保存,干冰运输。

 

3. 细胞

3.1 贴壁细胞

吸净培养容器中的培养基,并加入PBS,用细胞铲将细胞刮入离心管中(或加入适量PBS清洗1次细胞后用胰酶消化细胞,加入血清终止反应后收集于离心管中),离心去掉上清,再加入PBS清洗细胞2次,离心后样本放入液氮或-80度冰箱中保存,细胞总量不低于107个。


3.2 悬浮细胞

将细胞悬液转移至样品管中,离心弃掉上清。去除上清后用PBS清洗细胞2-3次,直至把所有的培养基去除干净;将离心后的细胞放入液氮或-80℃冰箱中保存。细胞总量不低于107个。

 

3.3 甲醛交联细胞

如果您做的是ChIP染色质免疫共沉淀实验,需要先对细胞进行甲醛交联。  交联方法如下:

1)胰酶消化收集一千万个细胞;

2)用预冷的PBS漂洗3次,每次在4℃条件下500 g 离心5 min离心去掉上清

3)加入终浓度为1 %PBS稀释)的甲醛,总体积为10 mL,室温交联10 min

4)加入终浓度为0.125 M 甘氨酸(PBS溶解)的甘氨酸,终止交联10min

5)4℃条件下500 g离心5 min,去掉上清,用预冷的pbs漂洗3次,每次在4℃条件下500g离心5 min;

6)细胞沉淀液-80℃保存,备用。

方法二:

1)取出1平皿细胞(10cm平皿),加入190ul 37%甲醛,使得甲醛的终浓度为1%。(培养基共有7ml

27℃孵育10min(恒温培养箱)

3)终止交联:加 350ul 2.5M甘氨酸于平皿中。混匀后,在室温下放置5min即可。

4)吸尽培养基,用冰冷的PBS清洗细胞3次。

5)用PBScell刮下来,2000g离心5min,去上清。


4. 细菌悬液

将细菌悬液转移至样品管中离心,去除上清培养基,再用PBS清洗三次,清洗干净后,将菌体沉淀转移至1.5mlEP管中,封口膜封口,管子上做好标记,将样品放入-80℃冰箱中保存,干冰运输。


5. 血液样本

5.1 全血

采集新鲜血液放置抗凝管或血袋中保存,样本量大于2ml,需当天送达,4℃运输。或者新鲜血液分离白细胞,分离后的白细胞样本放入-80℃冰箱中保存,干冰运输。


5.2 血清

使用非抗凝管(或无热原无内毒素的离心管)采集血液样本,室温下静置1-3个小时不等或4℃静置过夜使其自然凝固,2000-3500/4℃低温离心10-20min,吸取收集上清,血清需要量为200ul,如量较多建议分装保存,避免反复冻融,-80℃冰箱中保存,干冰运输。

 

5.3 血浆

使用抗凝管(可根据样本选择EDTA、肝素钠、柠檬酸钠或枸橼酸纳作为抗凝剂)采集血液样本,混合10-20分钟后,2000-3000/4℃条件离心20分钟(或4000/分离心5min),仔细吸取收集上层液体,血清需要量为200ul,如量较多建议分装保存,避免反复冻融,-80℃冰箱中保存,干冰运输。 





三、 样本准备注意事项

1)如果EP管中加了裂解液等液体,请勿直接放入液氮中,迅速冷到可能会导致管子炸裂。

2)各样品管上做好清晰的样品标记,尽可能简化标记、方便区分和识别。

3)放置样本的EP管应用封口膜密封,防止样本泄露,装在密实封口袋中。封口袋上也写明样本信息,方便识别和保存。

4)请按要求填写《实验信息表》上信息,如样本名称、数量等信息;填写好后先发送一份电子版的给项目负责人保存,寄送时再打印一份放入样本中。

5)管上的标识要与样本信息表应相同,如不同请在《实验信息表》上另外注明。

 




四、 样本寄送

(1)对于需要4℃运输的样品,请采用冰袋运输;

(2)对于需要干冰运输的样品,建议用厚实的泡沫盒盛放干冰(干冰最好先用厚实塑料袋装),由于干冰可以挥发,所有准备的干冰量一定要足量,建议先用塑料袋装干冰,样本深埋,封紧泡沫盒;泡沫盒外再装一个纸箱,避免运输过程中泡沫盒受损。若严格按照以上条件执行,一般10公斤干冰可以维持3~4天时间。

3)快递样本请保证在工作日期间到达我公司。如果样品需要在周末到达,请提前与我们联系,并且寄送样本时提醒快递公司周末照常派件;如因样本在假期未能被正常派送而导致的问题,客户需承担相应损失,请知悉。

 


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