组学实验送样说明
样本制备和送样说明
2023-04-06
浏览量:589


一、样本准备量

  

实验类型

样本类型

样本要求

收集方法

运输条件

iTRAQ 、 TMT 、PRM、DIA

(Label free需要量为以上样本量的一半)

 

 

蛋白

3-6mg/组

见下文

干冰运输

细胞

1*10e7/组

见下文

干冰运输

动物组织

0.5g/组

见下文

干冰运输

植物组织

叶片

2g

见下文

干冰运输

根、茎、种子

3g

见下文

干冰运输

果实

40g

见下文

干冰运输

藻类

1ml

见下文

干冰运输

微生物

阴性菌

150ul/组

见下文

干冰运输

阳性菌

1.5ml/组

见下文

干冰运输

真菌

5g

见下文

干冰运输

血清、血浆

500ul

见下文

干冰运输

脑脊液

4ml

见下文

干冰运输

外泌体

100ul沉淀

见下文

干冰运输


注:以上样本量为经验所总结,如果实际检测样本蛋白量不满足实验需要,请按照实际情况增加送样量。如果样本比较容易收集,您也可以一次准备两份样本,分装保存。



二、样本收集

1. 细胞

1.1 贴壁细胞

吸净培养容器中的培养基,并加入PBS,用细胞铲将细胞刮入离心管中(或加入适量PBS清洗1次细胞后用胰酶消化细胞,加入血清终止反应后收集于离心管中),离心去掉上清,再加入PBS清洗细胞2次,离心后样本放入液氮或-80度冰箱中保存,细胞总量不低于107个。

1.2 悬浮细胞

将细胞悬液转移至样品管中,离心弃掉上清。去除上清后用PBS清洗细胞2-3次,直至把所有的培养基去除干净;将离心后的细胞放入液氮或-80℃冰箱中保存。细胞总量不低于107个。

 

【注意事项】

1)细胞个头大小也会影响蛋白量,如果实测样本蛋白量不满足实验需要,请按照实际情况增加送样量。如果样本比较容易收集,您也可以一次准备两份样本,分装保存。

2PBS需要去除,不可以与细胞一起保存。

 

2. 组织样品

组织离体15分钟内,立即将其用消毒过的刀具切成黄豆大小(直径约0.5cm)的小块,用PBS或生理盐水洗净血液、体液等影响实验结果的残留成分。随后将样本小块置于液氮中速冻,放入EP管中保存,再放入-80℃冰箱中或者液氮罐中保存,干冰运输。

【注意事项】

1)样本不要在生理盐水中过久地漂洗。

2)干冰或低温冰箱降温速度缓慢,样本直接放进冰箱或干冰中容易引起降解,故取样后建议短时间内放入液氮中速冻,冷冻后的样本再转移到干冰或-80℃冰箱中。

 

3. 植物组织

3.1 叶片、花

直接将叶片或花剪下,用无菌双蒸水洗净;用锡箔纸包好后放入液氮或者-80℃冰箱保存。

3.2 根、茎

将要取的根部用无菌双蒸水洗净,去除泥土等物质;如样本根的体积很小,冷冻后易碎,需用锡箔纸包好后放入液氮,或置于-80℃冰箱保存;如根体积较大,取样时先将根部剪成小块,用锡箔纸包好后放入液氮或-80℃冰箱中保存。

3.3 果实

切下组织后用无菌双蒸水洗净;用锡箔纸包好后放入液氮或-80℃冰箱中保存。

3.4 藻类

离心收集并用PBS清洗干净,约1-2mL沉淀可以提取到1mg蛋白,送样时最好用进口EP管分装为300-500μL/管。

 

【注意事项】

1)组织块用锡箔纸包裹着,放入液氮迅速降温。不要保存在EP管里(冷冻后不易取出);

2)操作时间过长可能会导致样本降解。由于袋子上的字迹容易被抹去,可以在袋子里放一张纸片,纸片上写编号信息,若样本体积太大可以分成若干份;

3)以上样本量为经验值,如果实际检测样本蛋白量不满足实验需要,请按照实际情况增加送样量。如果样本比较容易收集,您也可以一次准备两份样本,分装保存。

 

4. 微生物

    4.1 微生物悬液

将细菌悬液转移至样品管中离心,去除上清培养基,再用PBS清洗三次,清洗干净后离心,将菌体沉淀转移至1.5mlEP管中,封口膜封口,管子上做好标记,将样品放入-80℃冰箱中保存,干冰运输。

    4.2 果皮微生物

样本处理后,根据菌斑出现的位置,用生理盐水或者无菌PBS浸湿的拭子把果表面擦拭一遍,每个样本使用3-5根左右进行擦拭,擦拭完成后,将每个取样点的棉签头剪下集中放入 2-5 ml 灭菌冻存管,棉签完全浸泡完全,盖子盖紧密封。记录采样样品的相应信息(样本名,采样时间等),液氮速冻,-80℃保存,干冰寄送。

【注意事项】取样过程中需佩戴口罩,每个样本取样时需更换无菌手套。

 4.3 皮肤微生物

将生理盐水浸湿的无菌拭子按在取样表面上,用力使其弯曲与擦拭表面成45度,平稳而缓慢地擦拭取样表面。翻转拭子,让拭子的另一面也进行擦拭,但与前次擦拭移动方向垂直,取样位置应避免与微生物取样点重复。擦拭完成后,将每个取样点的棉签头剪下集中放入2-5 ml 灭菌冻存管,棉签完全浸泡完全,盖子盖紧密封,每管保存3-5个拭子。记录采样样品的相应信息(样本名,采样时间等),液氮速冻,再放入-80℃保存,干冰寄送。

【注意事项】取样过程中需佩戴口罩,每个样本取样时需更换无菌手套。

 

5. 血液样本

5.1 全血

采集新鲜血液放置抗凝管或血袋中保存,样本量大于2ml,需当天送达,4℃运输。或者新鲜血液分离白细胞,分离后的白细胞样本放入-80℃冰箱中保存,干冰运输。

5.2 血清

使用非抗凝管(或无热原无内毒素的离心管)采集血液样本,室温下静置1-3个小时不等或4℃静置过夜使其自然凝固,2000-3500/4℃低温离心10-20min,吸取收集上清,血清需要量为200ul,如量较多建议分装保存,避免反复冻融,-80℃冰箱中保存,干冰运输。 

5.3 血浆

使用抗凝管(可根据样本选择EDTA、肝素钠、柠檬酸钠或枸橼酸纳作为抗凝剂)采集血液样本,混合10-20分钟后,2000-3000/4℃条件离心20分钟(或4000/分离心5min),仔细吸取收集上层液体,血清需要量为200ul,如量较多建议分装保存,避免反复冻融,-80℃冰箱中保存,干冰运输。


 

 

三、样本准备注意事项

1)如果EP管中加了裂解液、PBS等液体,请勿直接放入液氮中,迅速冷到可能会导致管子炸裂。

2)各样品管上做好清晰的样品标记,尽可能简化标记、方便区分和识别。

3)放置样本的EP管应用封口膜密封,防止样本泄露,装在密实封口袋中。封口袋上也写明样本信息,方便识别和保存。

4)请按要求填写《实验信息表》上信息,如样本名称、数量等信息;填写好后先发送一份电子版的给项目负责人保存,寄送时再打印一份放入样本中。

5)管上的标识要与样本信息表应相同,如不同请在《实验信息表》上另外注明。


 

四、样本寄送

(1)对于需要4℃运输的样品,请采用冰袋运输;

(2)对于需要干冰运输的样品,建议用厚实的泡沫盒盛放干冰(干冰最好先用厚实塑料袋装),由于干冰可以挥发,所有准备的干冰量一定要足量,建议先用塑料袋装干冰,样本深埋,封紧泡沫盒;泡沫盒外再装一个纸箱,避免运输过程中泡沫盒受损。若严格按照以上条件执行,一般10公斤干冰可以维持3~4天时间。

3)快递样本请保证在工作日期间到达我公司。如果样品需要在周末到达,请提前与我们联系,并且寄送样本时提醒快递公司周末照常派件;如因样本在假期未能被正常派送而导致的问题,客户需承担相应损失,请知悉。

 


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