Flag和3FLAG蛋白融合标签的区别
实验干货 分享
2023-10-27
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Flag标签蛋白为编码8个氨基酸的亲水性多肽(DYKDDDDK/Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys),FLAG-Ta中连着的四个天冬氨酸让整个标签蛋白具有很好的亲水性,其通常不会与目的蛋白相互作用并且通常不会影响目的蛋白的功能、性质,这样就有利用研究人员对融合蛋白进行下游研究。FLAG和3FLAG本身有免疫原,都含有DDDDK,而这个通常是FLAG抗体的结合表位,,所以对于常用的FLAG抗体来说,这几种标签都可以识别。这样就方便通过Western Blot、ELISA等方法对含有FLAG的融合蛋白进行检测、鉴定。

通常情况下FLAG标签会构建到蛋白的N端或者C端,大多数情况下蛋白的N端或者C端是游离在蛋白表面的,所以在这种情况下FLAG和3xFLAG没有区别,抗体都可以结合。但是也有时候蛋白前端或末端会被折叠到蛋白内部,或者被其他结合蛋白所遮蔽,此时,更长的3FLAG标签更有利于抗体结合表位的暴露,从而被抗体识别。


Flag序列信息:

蛋白序列:DYKDDDDK(Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys)

DNA编码序列:GATTACAAGGACGACGATGACAAG

分子量:1012.95g/mol


3Flag第一种形式:

蛋白序列:NH2-DYKDDDDKGDYKDDDDKIDYKDDDDK-COOH(NH2-Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys-Gly-Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys-Ile-Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys-COOH)

DNA编码序列:GATTACAAGGATGACGACGATAAGGGAGATTACAAGGATGACGACGATAAGATCGATTACAAGGATGACGACGATAAG

分子量:3173.09g/mol


3Flag第二种形式:

蛋白序列:DYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDK(Asp-Tyr-Lys-Asp-His-Asp-Gly-Asp-Tyr-Lys-Asp-His-Asp-Ile-Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys)

DNA编码序列:GACTACAAAGACCATGACGGTGATTATAAAGATCATGACATCGATTACAAGGATGACGATGACAAG

分子量:2730.79 g/mol


3Flag第三种形式:

蛋白序列:DYKDDDDKDYKDDDDKDYKDDDDK(Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys-Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys-Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys)

DNA编码序列:GATTACAAGGATGACGACGATAAGGACTATAAGGACGATGATGACAAGGACTACAAAGATGATGACGATAAA

分子量:3002.98 g/mol





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